Создан суперанализ на бактерии

Диагностическая платформа BacCapSeq

В Колумбии ученые Центра, занимающегося исследованиями инфекций и иммунитета, разработали диагностическую платформу BacCapSeq, позволяющую идентифицировать бактериального возбудителя, степень его вирулентности и возможную антибиотикорезистентность. Чувствительность нового инструмента превышает чувствительность стандартных анализов примерно в 1000 раз. Еще одним достоинством метода является скорость получения результата. Окончательный ответ, в том числе данные устойчивости к антибиотикам, получают спустя 70 часов после сдачи анализа. Ученые рассчитывают еще больше уменьшить требуемое для исследования время за счет повышения мощностей вычисления. Это особенно важно, поскольку позволяет снизить темпы появления антибиотикорезистентных штаммов бактерий.

В основу BacCapSeq положена база данных, включающая более 4 миллионов генетических зондов. Каждый из них способен связываться со специфической белковой последовательностью при условии ее наличия в образце. В ходе исследования могут быть обнаружены не только ДНК патогенных микроорганизмов (больше 300 видов), но и особые биомаркеры для определения характеристик возбудителя. Универсальность тест-системы, позволяющей выявить большинство известных возбудителей, делает ее уникальной. Современные мультисистемы на основе ПЦР созданы таким образом, что с их помощью может осуществляться поиск не более 19 возбудителей одновременно.

Эффективность BacCapSeq проверялась на анализах крови, взятых у пациентов с сепсисом неуточненной этиологии, на культурах крови, на субстратах с экстрагированными нуклеиновыми кислотами и на других образцах. Для сравнения параллельно проводилось тестирование с использованием традиционных методов. Результаты, полученные с помощью новой платформы, значительно превзошли по эффективности все другие варианты анализов.